Régulation épigénétique de l’identité cellulaire (Dr Michaël Weber)

Thématique de recherche

Les modifications épigénétiques influencent l'expression des gènes et jouent de nombreux rôles dans la régulation du génome. La mise en place du programme épigénétique est cruciale pour établir l'identité cellulaire, et sa stabilité est essentielle pour maintenir le fonctionnement des cellules. La dérégulation des voies  épigénétiques contribuent à l'apparition de nombreuses pathologies humaines, en particulier les cancers.

Notre équipe s'intéresse plus particulièrement à la méthylation de l'ADN, une marque chimique des cytosines catalysée par les enzymes de la famille des ADN méthyltransférases (DNMT). Chez les mammifères, la méthylation des cytosines a lieu principalement au niveau de dinucléotides CpG. Nos objectifs sont de mieux comprendre les rôles de la méthylation de l'ADN dans l'intégrité du génome et l'identité cellulaire, et d'identifier les voies moléculaires qui remodèlent les profils de méthylation de l'ADN dans les cellules mammifères. Pour cela, nous utilisons des technologies de cartographies épigénétiques à grande échelle par séquençage haut-débit en combinaison avec des approches de génétique fonctionnelle, bioinformatique, et biologie moléculaire. 

Rôles de la méthylation de l’ADN au cours du développement des mammifères. Nous utilisons des approches de cartographie de l’épigénome à grande échelle afin d'étudier la reprogrammation et les séquences cibles de la méthylation de l’ADN au cours du développement. En complément, nous utilisons des approches fonctionnelles et des modèles de souris invalidées pour les gènes Dnmt afin de tester génétiquement les mécanismes d'action de la méthylation de l’ADN. Ces travaux permettent de comprendre l’importance de la méthylation de l’ADN pour la régulation du transcriptome et le maintien de l'identité des cellules.

Etude des facteurs qui ciblent et remodèlent la méthylation de l'ADN dans le génome. Nous souhaitons mettre à jour les voies moléculaires qui ciblent la méthylation de l’ADN au cours du développement embryonnaire et tumoral chez les mammifères. Pour cela, nous menons des projets de criblage biologique et des études fonctionnelles sur des facteurs candidats par inactivation génétique. Ces travaux permettent de comprendre les mécanismes de ciblage de la méthylation de l’ADN et d'identifier de nouvelles cibles moléculaires pour le développement de thérapies épigénétiques.

Role et manipulation de la méthylation de l'ADN dans les conditions pathologiques. Nous utilisons des modèles cellulaires pour modéliser certaines pathologies causées par des anomalies de méthylation de l'ADN, étudier les conséquences moléculaires des dérégulations de méthylation et développer des outils biotechnologiques pour corriger la méthylation de l'ADN dans ces contextes pathologiques.

Soutiens Financiers

Membres de l'équipe

Publications

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